Fornleifar leifar Ixtépete, hátíðlegs miðbæjar nálægt borginni Guadalajara í sveitarfélaginu Zapopan og nýlegar niðurstöður yfir tuttugu öxulgröfa í Atemajac-dalnum leyfa okkur að álykta að það hafi verið mikilvæg störf á klassíska tímabilinu (200 BC-650 e.Kr.)
Stuttu fyrir landvinninginn var dalurinn að mestu byggður af hópum Cocas og Tecuexes, safnaðist saman í litlum þorpum háð yfirráðum Tonallan, sem Nuño Beltrán de Guzmán lagði fram án mikillar mótstöðu árið 1530.
Í lok næsta árs tók Guzmán undir sig landvinninginn í norðri og fól Juan de Oñate að fara yfir gil Santiago árinnar og eins langt og mögulegt er en með gætni fann hann spænska íbúa án þess að afhjúpa sig. Þannig var stofnað 5. janúar 1532 í nágrenni Nochistlán, í núverandi Zacatecas, Guadalajara.
Aðstæður sem voru slæmar fyrir landnemana ollu flutningi þessarar borgar til Tonalá, en dvölin þar var stutt og fljótlega eftir að Rómönsku löndin settust að nálægt Tlacotan, þar sem þau voru til ársins 1541. Uppreisn kaxkana, betur þekkt sem Mixtón stríðið, sem Hann setti spænska stjórn í verulega hættu, hann náði útjaðri Guadalajara. Þegar uppreisnin var sett niður „með eldi og blóði“ af valdamiklum her undir forystu Antonio de Mendoza, yfirmanns, náði borgin friði en var skilin eftir án frumbyggja, svo að í leit að þeim, ákváðu þeir að flytja íbúa og fundu fullnægjandi Valle de Atemajac, þar sem síðasti og endanlegi grunnurinn var lagður til 14. febrúar 1542. Síðar voru fréttirnar staðfestar að næstum þremur árum áður hafði konungur veitt henni stöðu og forréttindi borgarinnar.
Árið 1546 stofnaði Páll III páfi biskupsembættið í Nueva Galicia og árið 1548 var Audiencia samnefndur stofnaður; Höfuðstöðvar beggja lögsagna voru, upphaflega í Compostela, Tepic, þar til árið 1560 var skipað um breytingu á Guadalajara, sem gerði það að dómsmálastjóra víðfeðma svæðisins sem þá var kallað Audiencia í Guadalajara, höfuðborg konungsríkisins Nueva Galicia og aðsetur. biskupsstofu. Þar sem hver spænsk borg var dregin eins og skákborð frá því sem var San Fernando torgið og einnig eins og venjan var, voru frumbyggjahverfin Mexicaltzingo, Analco og Mezquitán útundan áætluninni. Boðunarferlið var hafið af Fransiskönum og síðan Ágústínumenn og Jesúítar.
Smám saman, með erfiðleikum og áföllum en einnig með árangri, óx Guadalajara og festi sig í sessi sem efnahags- og valdamiðstöð, svo mikið að um miðja 18. öld vildi verulegur fjöldi auðmanna frá Guadalajara að Nueva Galicia og Nueva Vizcaya myndu samþætta algerlega erlendan yfirmann. til Nýja Spánar, markmið sem ekki náðist vegna þess að pólitískar stjórnsýsluumbætur árið 1786 voru í sjónmáli, sem breyttu landhelginni og skiptu öllu yfirráðinu í 12 sveitarfélög, þar af eitt Guadalajara.
Í nýlendunni, einkum á 18. öld, skilur efnahagsuppgangurinn eftir sig arfleifð byggingarlistar, menningar og listræni, sem vitnisburðurinn er enn um alla borgina.
Loftur sjálfstæðismanna, sem hljóp um yfirráðasvæði Nýja Spánar, kom inn í Jalisco, þannig að þegar upp kom sjálfstæðisstríðið á mismunandi stöðum í sveitarfélaginu.
Hinn 26. nóvember 1810 fór Don Miguel Hidalgo, sem stjórnaði stórum her, inn í Guadalajara og tók á móti honum José Antonio Torres, sem skömmu áður hafði tekið borgina. Hidalgo gaf hér út tilskipun um að afnema þrælahald, stimplað pappír og alkabala og styrkti prentun uppreisnarblaðsins El Despertador Americano.
17. janúar 1811 voru uppreisnarmennirnir sigraðir á Calderón-brúnni og konungssveitir Calleja endurheimtu Guadalajara, að því gefnu að stjórnin José de la Cruz, sem með Cabañas biskupi, útrýmdi uppreisninni.
Boðað sjálfstæði árið 1821, frjálsa og fullvalda ríki Jalisco var reist og skilur Guadalajara eftir sem höfuðborg ríkisins og aðsetur valda.
Óstöðugleikinn sem ríkti í nánast alla nítjándu öld í landinu, aukinn af erlendum innrásum, gerði það erfitt, en kom ekki í veg fyrir að ríkið og sérstaklega í höfuðborg þess héldi áfram þróun í ýmsum skipunum. Áþreifanleg dæmi eru: á öðrum aldarfjórðungi, stofnun Rannsóknarstofnunar ríkisins; byggingu lista- og handíðaskólans, grasagarðsins, fangelsisins og Pantheon í Betlehem, auk opnunar fyrstu verksmiðjanna.
Í byrjun níunda áratugarins birtust þéttbýlisvagnar af gripi dýra, rafmagnsljósið var sett upp 1884, árið 1888 kom fyrsta járnbrautin í Mexíkó og sú í Manzanillo árið 1909. Á tíunda áratugnum stofnaði Don Mariano Bárcena stjarnvísindastofnunina og Iðnaðarsafnið.
Í byltingunni, í Guadalajara, urðu nokkur uppreisn gegn Díaz einræðinu, svo sem verkföll verkamanna og mótmæli stúdenta, og Madero var jafnvel tekið á móti 1909 og 1910 með mikilli samúð. Samt sem áður voru engir stríðsaðgerðir í kjölfarið. Á hinn bóginn varð höfuðstaður Guadalajara fyrir eins konar stöðnun sem lauk árið 1930 þegar búið var að samþykkja friðinn sem brotinn var af Cristeros-stríðinu og hóf löngun til nútímavæðingar sem ekki er lokið.
Sjá einnig Colonial Cities: Guadalajara, Jalisco
