Saga borgarinnar sem upphaflega var kölluð konungsríkið Nýja Galisía heldur áfram.
Það er líka gamli Jesuit háskólinn í Santo Tomás de Aquino, byggður á síðasta áratug 16. aldar og sem 1792 var hernuminn af háskólanum. Af byggingunni er aðeins eftir það sem var kirkjan, með minnisvarða hvelfingu sína frá síðustu öld, og meðfylgjandi Loreto kapellu, byggð árið 1695 af Juan María de Salvatierra. Musteri San Juan de Dios, sem áður var kapella Santa Veracruz, reist á 16. öld af Don Pedro Gómez Maraver, var reist á 18. öld með barokkhlið með edrú einkennum. Kirkjan í La Merced, með svipuðum barokkstíl og San Juan de Dios, þótt hún væri íburðarminni, var stofnuð á 17. öld af bræðrunum Miguel Telmo og Miguel de Albuquerque.
Musteri La Soledad var reist undir lok 17. aldar og í byrjun 18. aldar að beiðni Juana Romana de Torres og eiginmanns hennar, Juan Bautista Panduro skipstjóra. Á staðnum var bræðralag frúarinnar í einveru og hins heilaga gröf, þar sem hún hýsti kapellu tileinkaða San Francisco Xavier. Musterið og skólinn í San Diego, verk aldarinnar XVII; sú fyrsta með mjög edrú framhlið sem virðist þegar tilheyra nýklassískum stíl og sú síðari með fallegum spilakassa sem prýðir gamla klaustrið sitt.
Kirkja Jesús María, tengd samnefndu klaustri, var stofnuð árið 1722; það varðveitir ennþá barokkhliðina, þar sem sjá má stóra skúlptúra sem tákna Sagrada Familia, Virgen de la Luz, San Francisco og Santo Domingo.
Að lokum er mikilvægt að varpa ljósi á þrjár trúarlegar byggingar sem hafa komið fram sem bestu dæmin, hvert og eitt sinnar tegundar, um þróun nýlenduarkitektúrs í Guadalajara, aðallega milli sautjándu og átjándu aldar. Þannig höfum við Aránzazu kapelluna, frá því um miðja 18. öld, með forvitnilegu klukkukerfi sínu og innréttingum skreytt með stórfenglegu málverki og Churrigueresque altaristöflum frá sama tíma og talin þau bestu í borginni. Klaustrið og kirkjan Santa Mónica, stofnuð af föður Feliciano Pimentel á fyrri hluta 18. aldar; musteri þess sýnir tvöfalda framhlið með ríkulegu skrauti sem flokkað er sem besta dæmið um uppblásinn sólómónískan barokkstíl. Musteri San Felipe Neri, byggt árið 1766 af arkitektinum Pedro Ciprés, myndar mengi óvenjulegrar edrúmennsku sem felur í sér þætti með platereskum endurminningum í skrauti sínu, þáttur sem setur musterið sem bestu trúarbyggingu í Guadalajara.
Í mannvirkjunum sem svara til borgaralegrar byggingarlistar eru nokkrar aðdáunarverðar byggingar, þar á meðal má nefna stjórnarhöllina, gömul konungshús sem breytt var á 18. öld í kjölfar verkefnis hernaðarverkfræðingsins Juan Francisco Espino, þó að framhliðin hafi verið verk Miguel José Conique. Byggingin var hugsuð í barokkstíl en ákveðnar nýklassískar tilhneigingar eru þegar áberandi í henni. Konunglegu skrifstofurnar, sem voru í hinu horfna Palacio de Medrano, og réttarsalirnir störfuðu á staðnum.
Við höfum einnig það sem var Conciliar Seminary tileinkað San José, vígt af Galindo y Chávez biskupi árið 1701, í dag hernumið af byggðasafninu í Guadalajara, með aðal klaustri dálkanna í Toskana-stíl og barokkdyrum. Hinn frægi Hospicio Cabañas var reistur í byrjun 19. aldar, í kjölfar áætlana hins glæsilega arkitekts Manuel Tolsá, leikstýrði verkinu José Gutiérrez og kláraði hann árum síðar af arkitektinum Gómez Ibarra, og sem er merkilegt dæmi um nýklassískan stíl.
Meðal annarra minniháttar mannvirkja sem veittu borginni Guadalajara stílbundna einingu, getum við nefnt, þó ekki séu öll varðveitt: glæsilegu 16. aldar höfðingjasetrið sem stóð fyrir framan það sem áður var San Sebastián torgið í Analco hverfinu. Húsið við Calle de la Alhóndiga nr. 114, sem stendur Pino Suárez. Íbúðirnar sem tilheyrðu Sánchez Leñero fjölskyldunni í nr. 37 og herra Dionisio Rodríguez í nr. 133 á Calle de Alcalde. Calderón húsið, hefðbundin nýlendu sælgætisverslun stofnuð árið 1729 og staðsett á horni gömlu götna Santa Teresa og Santuario, í dag Morelos og Pedro Loza; að Francisco Velarde, í nýklassískum stíl, og að lokum sá sem var Cañedo höfðingjasetur, staðsett fyrir aftan bak dómkirkjunnar.
Í nágrenni Guadalajara, þriðju mikilvægustu borgar landsins, er gamli bærinn í San Juan Bautista Melzquititlán, í dag San Juan de los Lagos. Þessi bær er orðinn mikilvægur trúarleg miðstöð vegna mikillar kraftaverkahefðar ímyndar Maríu meyjar sem varðveitir basilíkuna sína, reist um miðja 17. öld af Don Juan Rodríguez Estrada. Í sama bæ má sjá aðrar byggingar eins og musteri þriðju reglu, kapellu Golgata, kapellu fyrsta kraftaverksins, sem eru frá 17. og 18. öld. Það eru einnig mikilvægar borgaralegar byggingar meðal íbúanna, svo sem Háskóli háskólans og tíundarbyggingin, meðal annarra.
Í bænum Lagos de Moreno má sjá helstu sókn hennar, verk frá 17. öld með fallegri framhlið í Churrigueresque stíl.
Að lokum eru í San Pedro Tlaquepaque nokkur dæmi um barokk trúarlegan arkitektúr á svæðinu, svo sem sókn San Pedro og musterið í Soledad.
