Með aðeins þriggja eða fjóra mánaða rigningu á ári gat Colima uppfyllt nauðsynleg skilyrði fyrir mannlíf þökk sé mörgum lækjum sem komu frá efri hlutum Volcán de Fuego. Gögn sýna að maðurinn settist að í þessum dal um 1.500 f.Kr.
Menningin, þekkt sem Complejo Capacha, voru landbúnaðar- og kyrrsetufélög sem gáfu tilefni til hinnar frægu hefðar á skaftgröfum: líkhús þar sem ríku fórnir voru afhentir og aðgengilegar um lóðréttan og hringlaga bol frá 1.20 til 1.40 m í þvermál. Í frístundamiðstöðinni Tampumachay, í bænum Los Ortices, eru þrjár grafhýsi með upprunalegu skaftinu og hvelfingum og inni í röð steinskipa og verkfæra sem hinum látnu er boðið upp á.
Þegar trúarbrögð höfðu meira vægi í félagslegu skipulagi, frá 600 e.Kr., fóru að byggja hátíðleg rými úr torgum, afmörkuðum húsagörðum og rétthyrndum pöllum af töluverðum víddum. Byggingarflóknari byggðir þróuðust ekki fyrr en eftir 900 e.Kr.
Sá staður sem best stendur fyrir þennan áfanga er La Campana. Þetta er stór byggð - hátíðarsvæði hennar fór yfir 50 hektara - með röð af rétthyrndum pöllum. Efst á þessum pöllum eru svæði sem líklega tengjast kornageymslu. Það eru líka flókin íbúðakerfi sem eflaust hljóta að hafa verið hernumin af borgaralegum og trúarleiðtogum.
Tveir þættir skera sig úr á þessum vef: staðsetning grafhýsa sem eru samþætt í helgihaldi og tilvist flókins net frárennslis og vatnsrása.
Annar mikilvægur fornleifasvæði í Colima er El Chanal, sem staðsett er um 6 km norður af borginni, sem hlýtur að hafa lengst að hámarki 200 hektara. Þar sem það náði til beggja bakka Colima-árinnar er það þekkt sem El Chanal Este og El Chanal Oeste. Hið síðastnefnda, þó að það hafi ekki verið rannsakað að fullu, sýnir augljóst flækjustig þar sem það hefur húsagarða, torg, mannvirki, síki og götur. El Chanal Este var aftur á móti að mestu eytt vegna þess að nútímabærinn sem ber nafn sitt var stofnaður á rústum hans.
Rannsóknirnar sýna að á staðnum eru leiðbeinandi þættir í tvöfalda musterinu, hugmyndin um bekkjaltarið og altarispallarnir í litlum málum, auk mikils fjölda skúlptúra, leturgröftur og steinléttingar; tölur sem tengjast Xantiles; fjöllitað leirker sem myndar útlínur erna og fjaðra höggorma; og að lokum, málmur. En það athyglisverðasta við þessa menningu er nærvera þéttbýlisfyrirbæra og tilvist dagatalsins.
